【视频笔记】北大生信课 P69 12-2 裴钢教授关于研究背景的介绍

这一节主要记录高歌老师的提问和裴钢老师的思路解答（皆为大意概括），以及一些基础知识。
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细胞信号传导

细胞/机体接收外界信号后作出反应。
信号传入细胞内会引起两种变化：
1、快速变化；
2、长期变化 →导致基因改变。

表观遗传学现象

DNA不改变的前提下，基因组表达的区别的现象。其变化一般有两种途径：**
1、DNA修饰（甲基化：碱基上接甲基基团）；
2、细胞核组蛋白（histone）修饰

甲基化

对调控基因表达很重要，由DNA甲基化酶进行修饰

课题：甲基化修饰酶对甲基化的不同作用与细胞信号传导的关系
主要研究对象为甲基化酶3
Q：不同的甲基化是否来源于酶的不同功能？
研究思路：酶的氨基酸结构的改变与其功能的关系。

高歌老师提问：

Q1：实验生物学上如何确定特定功能对应的氨基酸位点？及其意义？

裴A：
使用理论推算和实验验证相结合的方法来确定其功能位点，在谈之某个氨基酸对蛋白质功能的影响时，可在实验中使其突变，或改变氨基酸含量，来对比观察和正常状态下的区别。
意义：
蛋白质是组成生物体细胞的框架；
蛋白质是细胞膜的重要组成；
蛋白质是信号传导分子之一；
细胞的代谢离不开蛋白质
基因的转录和表达离不开蛋白质

Q2：生信方法引入的作用？
裴A：给予研究一个“导向地图”

Q3：验证生信结论的方法？
裴A：利用生信获得某基因在不同物种上的表达，观察所研究蛋白在目标生物（模式生物）身上缺失后的改变（敲除法）；观察蛋白表达量对表达的影响；观察跨物种蛋白替换的表达结果