从今天起，开始复习之旅。

1 执行者 在Nextflow框架体系结构中，执行程序是确定运行管道进程并监督其执行的系统的组件。 所述执行器提供了流水线过程和底层执行系统之间的抽象。这使您可以独立于实际的处理平台编写管道功能逻辑。 换句话说，只需更改Nextflow配置文件中的执行程序定义，您就可以编写管道脚本一次，并使其在计算机，集群资源管理器或云上运行。 1.1 本地 在本地执行默认情况下使用。它在启动Nextflow的计算机中运行管道进程。通过产生多个线程并利用CPU提供的多核体系结构来使进程并行化。 在常见的使用场景中，本地执行程序对于在计算机中开发和测试管道脚本很有用，当需要在生产数据上运行它时，可以...

Nextflow 运算符是使您可以使用一些用户提供的规则将通道彼此连接或转换通道发出的值的方法。 运算符可以分为七个组： 过滤算子 变换算子 分裂算子 组合算子 分叉算子 数***算符 其他操作员 1 过滤算子（运算符） 给定一个通道，过滤运算符允许您仅选择符合给定规则的项目。 可用的过滤器运算符为： distinct filter first last randomSample take unique until 1.1 filter 该filter运算符允许你只得到通过满足条件并丢弃所有其他的通道发出的...

1 通道 Nextflow基于数据流编程模型，其中流程通过通道进行通信。 通道具有两个主要属性： 发送消息是一个异步操作，无需等待接收过程即可立即完成。 接收数据是一项阻塞操作，它将停止接收过程，直到消息到达为止。 2 通道类型 Nextflow区分两种不同的通道：队列通道和值通道。 2.1 队列通道(queue channel) 队列信道是一个无阻塞的单向FIFO队列，它连接两个进程或操作符。‘ 通常使用工厂方法（如from，fromPath等）创建队列通道，或使用map，flatMap等通道操作符将其链接起来。 队列通道也是通过使用into子句的进程输出声明创建的。 ...

1 输出 输出声明块允许定义所使用的过程中发出所产生的结果的通道（Channels）。 最多可以定义一个输出块，并且可以包含一个或多个输出声明。输出块遵循以下语法： output: <output qualifier> <output name> [into <target channel>[,channel,..]] [attribute [,..]] 输出定义以输出限定符和输出名称开头，后跟关键字into和一个或多个通过其发送输出的通道。最后，可以指定一些可选属性。 下表中列出了可以在输出声明块中使用的限定符： ...

在Nextflow中，进程是执行用户脚本的基本处理原语。 进程定义以关键字开头process，其后是进程名称，最后是 由括号括起来的进程主体。进程主体必须包含一个表示命令的字符串，或更一般地，该字符串代表由该命令执行的脚本。基本过程如下例所示： process sayHello { """ echo 'Hello world!' > file """ } 一个流程可能分别包含五个定义块：指令，输入，输出，when子句以及最后一个流程脚本。语法定义如下： process < name > { ...

Nextflow脚本语言是Groovy编程语言的扩展。Groovy是Java虚拟机的强大编程语言。Nextflow语法已专门用于以声明性方式简化计算流水线的编写。 Nextflow可以执行任何Groovy代码或对JVM平台使用任何库。 有关Groovy编程语言的详细说明，请参考以下链接： Groovy User Guide 1 语言基础 1.1 Hello World 打印某些内容与使用print或println方法之一一样容易。 println "Hello, World!" 两者之间的唯一区别是该println方法隐式地将新行字符附加到打印的...

1 基本概念 Nextflow是一个反应式工作流框架和一个编程DSL ，可简化数据密集型计算管道的编写。 它是基于Linux平台是数据科学的通用语言这一思想而设计的。Linux提供了许多简单但功能强大的命令行和脚本工具，将它们链接在一起时，便可以简化复杂的数据操作。 Nextflow扩展了这种方法，增加了基于数据流编程模型定义复杂程序交互和高级并行计算环境的能力。 2 Processes (进程)和 channels （通道） 在实践中，通过将不同的进程结合在一起来制作Nextflow管道脚本。可以用Linux平台可以执行的任何脚本语言（Bash，Perl，Ruby，Python等）...

1 简介 Nextflow是由Barcelona Center for Genomic Regulation (CRG)的比较生物信息学小组研发的，在2014年开源，基于GPL3软件许可发布，在github上可以下载到源代码。由于其敏捷、灵活、兼容性强等特点，迅速成为生物信息学研究领域内广受欢迎的开发工具。 ​​在科学计算领域，Linux系统可以说是一个所有科研人员的通用平台，提供了许多简单的命令行和脚本工具，这些程序非常精简强大，如果能够按照一定的规则连接起来，就能够处理更加复杂庞大的数据。而Nextflow的设计正是基于这种目标实现的，它是一种工作流框架，包括了独立的编程语法，能够大大...

1 安装 首先进入官网，找到Anaconda3下载地址。 执行命令，进行下载： wget --no-check-certificate https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh 下载后，执行命令按照提示进行安装 sh Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh 出现下面界面，点击Enter键就可以 然后一直点击Enter键，直到出现下面的界面： 输入yes，接受，然后出现下面界面： 这个地方就是说，默认给你安装到/root目录下，安装好后你可以在该文件夹...

Token： Token服务器端会话技术 自定义的Session 如果在Web页面开发中，使用基本和Session一致 如果使用移动端或客户端开发中，通常以Json形式传输，需要移动端自己存储Token，需要获取Token关联数据的时候主动传递Token。 Cookie、Session和Token的对比 Cookie使用更简洁，服务器压力更小，数据不是很安全 Session服务器要维护Session，相对安全 Token拥有Session的所有优点，自己维护略微麻烦，支持更多的终端。 1 为什么要用 Token？ 而要回答这个问题很简单——因为...

1 概念 Session：在计算机中，尤其是在网络应用中，称为“会话控制”。Session对象存储特定用户会话所需的属性及配置信息。这样，当用户在应用程序的Web页之间跳转时，存储在Session对象中的变量将不会丢失，而是在整个用户会话中一直存在下去。当用户请求来自应用程序的 Web页时，如果该用户还没有会话，则Web服务器将自动创建一个 Session对象。当会话过期或被放弃后，服务器将终止该会话。Session 对象最常见的一个用法就是存储用户的首选项。例如，如果用户指明不喜欢查看图形，就可以将该信息存储在Session对象中。 Session： 服务器端会话技术 数据存...

1 出现场景 服务器如何识别客户端 Http在Web开发基本都是短连接。 2 请求声明周期 从request开始，到response结束。 3 种类 （1） Cookie： 客户端会话技术，数据存储在客户端 键值对存储 支持过期时间 默认Cookie会自动携带本网站的所有Cookie Cookie跨域名、跨网站 通过HttpResponse Cookie默认不支持中文 设置Cookie支持中文，Base64 Cookie可以加密 （2）Session （3）Token 4 Cookie 浏览器端的...

Django中的视图主要用来接收Web请求，并作出响应。视图本质就是一个Python函数。 视图的响应分为两大类： 以Json数据形式进行返回 以网页形式返回 重定向到另一个网页 错误视图（40X，50X） 视图的响应过程： 浏览器输入——> Django获取信息并去掉ip：端口，剩下路径——>URL路由匹配——>视图响应——>回馈到浏览器 1 URL配置 URL组成： 配置流程： settings中指定根级URL配置文件，对应的属性是ROOT_URLCONF。 urlpatterns...